Allie RDF Data Portal

Contents

1. 生命科学分野において利用されている略語とその展開形を検索するサービス「Allie」
   • 「Allie」へのリンク
   • 「Allie」のヘルプ
   
   
2. AllieのRDFデータ
   • SPARQLエンドポイント: http://data.allie.dbcls.jp/sparql
   • SPARQLエクスプローラーへのリンク
   • Faceted Searchへのリンク
   • Allie語彙情報へのリンク
   • AllieのRDFデータ構造
   
   
3. Allieが利用する略語とその展開形の組のリストのタブ区切りデータおよびAllieのRDFデータのダウンロードサイト
   • ダウンロードサイトへのリンク

Examples

• SPARQL クエリ
  1. 研究分野が細菌学(D001432)であるクラスターの略語と展開形のペアを取得
     PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#> PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#> PREFIX xsd: <http://www.w3.org/2001/XMLSchema#> PREFIX mesh: <http://id.nlm.nih.gov/mesh/> PREFIX allie: <http://purl.org/allie/ontology/201108#> select ?Frequency ?ShortForm ?LabelShortForm ?LongForm ?LabelLongForm where { graph <http://purl.org/allie> { [] a allie:PairCluster; allie:inResearchAreaOf mesh:D001432; allie:hasShortFormRepresentationOf ?ShortForm; allie:hasLongFormRepresentationOf ?LongForm; allie:frequency ?Frequency. ?ShortForm rdfs:label ?LabelShortForm . ?LongForm rdfs:label ?LabelLongForm . FILTER ( lang(?LabelShortForm) = 'en' && lang(?LabelLongForm) = 'en' && xsd:integer(?Frequency) >= 100 ) } } ORDER BY DESC (xsd:integer(?Frequency)) ?LabelShortForm ?LabelLongForm クエリ実行
     
     
  2. 略語が"SPF"で展開形が"specific pathogen-free"であるクラスターの展開形バリエーションを取得
     PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#> PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#> PREFIX allie: <http://purl.org/allie/ontology/201108#> select distinct ?LongForm ?LabelLongForm where { graph <http://purl.org/allie> { [] a allie:PairCluster; allie:contains [ allie:hasMemberOf [ allie:hasLongFormOf ?LongForm ] ] ; allie:hasShortFormRepresentationOf [ rdfs:label 'SPF'@EN ]; allie:hasLongFormRepresentationOf [ rdfs:label 'specific pathogen-free'@EN ]. ?LongForm rdfs:label ?LabelLongForm FILTER ( lang(?LabelLongForm) = 'en' ) } } ORDER BY DESC(?LabelLongForm) クエリ実行
     
     
  3. "s"で始まらない略語と"specific"で始まる展開形のペアを取得
     PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#> PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#> PREFIX allie: <http://purl.org/allie/ontology/201108#> select ?ShortForm ?LabelShortForm ?LongForm ?LabelLongForm where { graph <http://purl.org/allie> { [] a allie:PairCluster; allie:contains [ allie:hasMemberOf [ allie:hasShortFormOf ?ShortForm ; allie:hasLongFormOf ?LongForm ]]. ?ShortForm rdfs:label ?LabelShortForm . ?LongForm rdfs:label ?LabelLongForm . FILTER (!regex(?LabelShortForm,'^s','i') && regex(?LabelLongForm, '^specific', 'i')) } } クエリ実行
     
     

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